🤩 Дарья Андреевна Килина, заведующая лабораторией HLA-типирования НМИЦ Алмазова, врач-генетик, выпускница Института биоинформатики, рассказала о том, как читать FastQC и не бояться красных метрик.
На встрече:
🟢Говорили о внедрении программ в работу над проектами.
🟢Разбирались с качеством NGS-данных, типичных паттернов для RNA-seq, метагенома, таргета и микроРНК.
🟢Учились отличать реальные проблемы от особенностей метода.
💬 Отзыв участницы Елены Нерубенко:
Встреча с экспертом Дарьей помогла глубже разобраться в отчетах программы FastQC. Я лучше поняла, по каким именно моментам могли быть допущены ошибки, которые приводят к информированию программой о том, что с данными что-то не так. Также было очень интересно узнать, что для некоторых типов данных секвенирования ошибки и предупреждения FastQC могут быть абсолютной нормой, так как программа заточена в первую очередь под секвенирование генома.